NyX startede som en selvejende organisation, der blev stiftet på initiativ af Kultur- og Erhvervsministeriet i 2002. Med et tilskud på tre millioner til de første to år etableredes projektorganisationen NyX. NyX har gennem årene 2002 - 2008 fundraiset og gennemført cirka 20 større og mindre projekter indenfor kultur- og erhvervfeltet med et samlet tilskud på omkring 50 millioner.
I dag er NyX et anpartsselskab med fokus på konceptudvikling og innovation.